프로토버퍼 같은 직렬화 라이브러리를 써서 데이터 클래스 정도를 같이 맞출수는 있겠지만
공통 로직을 맞추기엔 힘들어 보입니다.
Java를 C#으로 변환하는 프로그램을 짜시거나 하는건 비용이 너무 커지는 것 같아요.
실제 이런 것이 오픈소스로 존재한다고 해도 어디까지 변환이 잘 될지는 알 수 없는데..
이런 소스를 변환해주는 툴이 있는지 찾아보는게 최선일 것 같습니다.
아니면 C/C++로 공통 라이브러리를 짜셔서 Java와 C#에서 불러와서 사용하셔도 되겠네욤.
C/C++ 라이브러리에서 생기는 이슈 처리만 잘 하시면.. 될 것 같네욤.